BLASTN 2.2.3 [May-13-2002]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= BA0AB013G02LP1|AL426572
(566 letters)
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
1807 sequences; 10,358,551 total letters
Searching....done
Score E
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>3x_Contig664
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>3x_Contig1614
Length = 4869
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Identities = 564/573 (98%), Gaps = 9/573 (1%)
Strand = Plus / Plus
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Query: 413 ttttattttttcattttttcattttctcattttctcttttttaatcactctagacggatt 472
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Query: 355 c-aaatccgtacacc 368
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Query: 194 acatacctaatcaaatccgtacaccacatacctaatcaaatccgtacaccacatacctaa 253
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Query: 254 tcaaatccgtacaccacatacctaatcaaatccgtacaccacatacctaatcaaatccgt 313
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Query: 314 acaccacatacctaatcaaatccgtacaccacatacctaatcaaatccgtacacc 368
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Score = 504 bits (254), Expect = e-143
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Strand = Plus / Plus
Query: 96 acaccacatacctaatcaaatccgtacaccacatacctaatcaaatccgtacaccacata 155
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Query: 146 acaccacatacctaatcaaatccgtacacc-------taatcaaatccgtacaccacata 198
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Query: 319 acatacctaatcaaatccgtacaccacatacctaatcaaatccgtacacc 368
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Sbjct: 195 acatacctaatcaaatccgtacaccacatacctaatcaaatccgtacacc 244
>3x_Contig1807
Length = 66587
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Query: 62 caaatccgtacaccacatacctaatcaaa-----tccgtacaccacatacctaatcaaat 116
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Query: 117 ccgtacaccacatacctaatcaaatccgtacaccacatacctaatcaaatccgtacacc- 175
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Query: 176 ------taatcaaatccgtacaccacatacctaatcaaatccgtacaccacatacctaat 229
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Query: 230 caaatccgtacaccacatacctaatcaaatccgtacaccacatacctaatcaaatccgta 289
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Query: 290 caccacatacctaatcaaatccgtacaccacatacctaatcaaatccgtacaccacatac 349
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Query: 410 tttttttattttttcattttttcattttctcattttctcttttttaatcactctagacgg 469
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Sbjct: 625 tttttttattttttcattttttcattttctcattttctcttttttaatcactctagacgg 684
Query: 470 atttcctcttctggtaattttctttttctcattttctcattttctcattttctcttttct 529
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Query: 530 aatcactcgaaacggatttcctctttcggtaatttt 565
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Score = 661 bits (333), Expect = 0.0
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Strand = Plus / Plus
Query: 2 catacctaatcaaatccgtacaccacatacctaatcaaatccgtacaccacatacctaat 61
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Sbjct: 191 caccacagaccgaagcaaagccggacaccacagaccgaagcaaagccgtacacc 244
Score = 191 bits (96), Expect = 2e-48
Identities = 138/152 (90%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2 catacctaatcaaatccgtacaccacatacctaatcaaatccgtacaccacatacctaat 61
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Sbjct: 96 catacctaatcaaatccgtacaccacatacctaatcaaatccgtacaccacatacctaat 155
Query: 62 caaatccgtacaccacatacctaatcaaatccgtacaccacatacctaatcaaatccgta 121
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Sbjct: 156 caaatccgtacaccacagaccgaagcaaagccggacaccacagaccgaagcaaagccgga 215
Query: 122 caccacatacctaatcaaatccgtacaccaca 153
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Sbjct: 216 caccacagaccgaagcaaagccgtacaccaca 247
Score = 143 bits (72), Expect = 4e-34
Identities = 132/152 (86%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2 catacctaatcaaatccgtacaccacatacctaatcaaatccgtacaccacatacctaat 61
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Sbjct: 121 catacctaatcaaatccgtacaccacatacctaatcaaatccgtacaccacagaccgaag 180
Query: 62 caaatccgtacaccacatacctaatcaaatccgtacaccacatacctaatcaaatccgta 121
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Sbjct: 181 caaagccggacaccacagaccgaagcaaagccggacaccacagaccgaagcaaagccgta 240
Query: 122 caccacatacctaatcaaatccgtacaccaca 153
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Sbjct: 241 caccacagaccgaagcaaaggcggacaccaca 272
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
Posted date: Nov 27, 2002 12:23 PM
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Number of sequences in database: 1807
Lambda K H
1.38 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.38 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 8026
Number of Sequences: 1807
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effective search space: 5681301450
effective search space used: 5681301450
T: 0
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S1: 12 (24.3 bits)
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